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Hi-C基因组测序
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技术原理
Hi-C技术源于染色体构象捕获(Chromosome Conformation Capture—3C)技术,以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息学方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系;通过对染色质内全部DNA相互作用模式进行捕获,获得高分辨率的染色质三维结构信息,并与ATAC-seq、ChIP-seq、基因组、转录组等数据联合分析,从基因调控网络和表观遗传网络来阐述生物体性状形成的相关机制。
生信分析
分析内容=标准分析+高级分析。
构建染色体跨度单体型,基于全基因组的互作信息,获得高分辨率
的染色质三维结构信息,并能开发调控基因的DNA元件。
此外,还可结合转录组,重测序和ChIP-seq数据进行联合分析,从碱基变化、
基因表达、蛋白修饰及染色体三维构象分析等多方面深入探讨生物学问题。